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Mostrando entradas de enero, 2024

Dinámica molecular clásica

 Bienvenido,  Si lo que quieres es entender un poco mejor el proceso de dinámica molecular clásica orientado a biomoléculas... ¡Llegaste al lugar adecuado! Vamos a resumir los pasos y etapas involucradas en este proceso. Comencemos con entender ¿Qué es la dinámica molecular clásica? Te recomiendo ver el siguiente vídeo introductorio: También puedes acceder al vídeo en:  https://www.youtube.com/watch?v=bYyN_CyELeA Ahora explicaremos el proceso paso por paso: PREPARACIÓN DEL SISTEMA 1. Existen varios ensambles estadísticos que se pueden emplear en los sistemas.  Wereszczynski y McCammon, 2012 los definen como una colección de varios microestados de un sistema macroscópico en equilibrio según lo determinado por las restricciones que operan en dicho sistema.   Frecuentemente las simulaciones en  condiciones fisiológicas de los organismos vivos se llevan a cabo bajo condiciones de N, V, T, p y u constantes, y es por esa razón que se utilizan en el modelado...